شناسايي تغييرات اپيژنتيکي با نانوسياليت
گروهي از پژوهشگران
دانشگاه کرنل با استفاده از سيستمي
از کانالهاي نانوسياليت و ميکروسکوپ فلورسانس چندرنگي موفق به ابداع
روشي
شدند که ميتواند پيوند بين DNA و پروتئينهاي چسبيده به DNA، که به
هيستون
معروف هستند، را در مکانهاي ويژهاي در طول مولکولهاي منفرد DNA مورد
تحليل قرار دهد. دادههاي بدست آمده از اين روش اطلاعاتي درباره حالت به
اصطلاح اپيژنتيکي يک سلول، که منعکسکننده تفاوت ژنهايي است که يک سلول
مشخص در هر لحظه از زمان بروز ميدهد (express)، بدست ميدهند.
هر سلولي در بدن داراي ساختار ژنتيکي يکساني ميباشد پس چه عاملي باعث
تمايز سلولهاي جگر از سلولهاي قلب در يک سري از اصلاحات DNA، مانند
متيلاسيون، ميگردد؟ متيلاسيون ميتواند مجموعه ويژهاي از ژنهاي بروز
يافته از يک نوع خاصي از سلول را تعيين کند. اين اصلاحات به اصلاحات
اپيژنتيکي، و نه تغييرات ژنتيکي، معروف هستند زيرا آنها توالي DNA را
تغيير
نميدهند بلکه در خواص ساختاري آن تغييراتي ايجاد ميکنند.
تکنيکهاي فراواني براي مطالعه چنين تغييرات اپيژنتيکي در اختيار محققان
وجود دارد، ولي اين روشها نياز به تعداد بسيار زيادي سلول دارند و به
همين
خاطر تصوير ميانگيني از حالت اپيژنتيکي بدست ميدهند. علاوه بر اين، اين
روشها قادر به پيمايش کليه ژنها نيستند و حتي نميتوانند دو گونه از
تغييرات اپيژنتيکي را بهطور همزمان بررسي نمايند.
گروه کرنل براي رفع اين محدوديتها يک افزاره نانوسياليت ساخته است که
ميتواند جرياني از مولکولهاي منفرد DNA را از يک کانال و آشکارساز عبور
دهد و فلورسانس DNA و پروتئينهاي وابسته به آن را در هر لحظه از زمان
ضبط
و تحليل نمايد. اين پژوهشگران همچنين نشان دادند که قادر به جداسازي DNA
از
پروتئينها، برچسبگذاري آنها با مولکولهاي فلورسانسي که ميتوانند به
پايههاي متيله شده پيوند بخورند، و آشکارسازي مکانهاي مشخص متيلاسيون
DNA، هستند.
اين محققان در مجموعه آزمايشهاي خود، از سيستم نانوسياليت براي مشخص
کردن
فرکانس و انطباق حالتهاي اپيژنتيکي در مولکولهاي منفرد DNA استفاده
کردند. با اين حال، اين محققان معتقد هستند که قادر خواهند بود افزاره
خود
را براي منظمسازي ساختارهاي DNA- پروتئين بر اساس علامتهاي اپيژنتيکي
آنها استفاده کنند. قطعههاي کرومزومي منظم شده ميتوانند با ابزارهاي
مطالعاتي DNA، مانند توالي DNA، مورد مطالعه بيشتر قرار گيرند.
نتايج اين تحقيق در مجلهي Analytical Chemistry منتشر شده است.
